YRD. DOÇ. DR. GÖRKEM YAMAN

Van yöresinde hepatit B virüs genotip dağılımı ve prekor/bazal kor promoter mutasyon analizi

Akut hepatit ve asemptomatik taşıyıcılık, kronik taşıyıcılık, karaciğer sirozu ve hepatosellüler karsinom gibi kronik karaciğer hastalığının değişik formlarına sebep olan Hepatit B virüsü (HBV), tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de çok önemli bir toplum sağlığı problemi oluşturmaktadır. HBV genotipleri ve mutasyonları da hastalık seyrini ve tedavisini etkilemektedir. Bu çalışmada, Van yöresinde HBV genotiplerini ve prekor/bazal kor promoter mutasyonlarını tespit etmek amaçlanmıştır. Bu amaçla, Mart 2008-Ocak 2009 tarihleri arasında toplanan, hepatit B serolojik belirleyicileri (AXSYM, Abbott) ve HBV DNA’sı (Cobas Taqman, Roche) pozitif 54 hasta serumu çalışmaya dahil edilmiştir. Bu serumlarda DNA izolasyonu (QİAamp DNA Mini Kit, Qiagen) sonrası revers hibridizasyon metodu (INNO-LiPA, İnnogenetics) kullanılarak genotiplendirme ve mutasyon analizi yapılmıştır. Çalışma sonucunda, 54 hastanın tümünde (% 100) genotip D tespit edildi. 54 hastanın 5’i, mutasyon analizi için amplifikasyon sonrasında agaroz jel elektroforezde DNA bandı oluşmadığı için mutasyon analizi çalışmasından çıkarıldı ve çalışma 49 hasta ile yapıldı. Bu hastalarda G1896A prekor mutasyonu ve BKP mutasyonu sırayla % 40.9 ve % 34.7 olarak bulundu. Bu hastaların HBeAg durumları ile tespit edilen mutasyonlar değerlendirildiği zaman, HBeAg negatif hastalarda prekor mutasyonu % 75.0, bazal kor promoter mutasyonu % 57.9 olarak tespit edildi. 49 hastanın % 22.4’ü, HBeAg negatif hastaların ise % 50’si prekor ve BKP mutasyonlarının her ikisine de sahipti. Çalışmada çıkan sonuçlar irdelendiğinde, Akdeniz ve komşu Asya ülkelerinde olduğu gibi Türkiye’de Van yöresinde de HBV D genotipi dominantdır. Prekor ve BKP mutasyon analizi sonuçlarına bakıldığında ise, hepatit B hastalarının yaklaşık yarısı prekor mutasyonuna, üçte biri ise BKP mutasyonuna sahipti. Bu mutasyonlar HBeAg salınımını durdurmakta veya önemli ölçüde azaltmaktadır. Ülkemizde HBV’ye ait genotip ve mutasyonlara ait bu epidemiyolojik verilerin, HBV enfeksiyonuna sahip hastaların tanısında, izlenmesinde ve tedavi stratejisinde klinisyenlere yardımcı olacağı kanısına varılmıştır.

Şüpheli bruselloz olgularının altı farklı yöntemle değerlendirilmesi

Yüce M, Şüpheli Bruselloz olgularının altı farklı yöntemle değerlendirilmesi, Y.Y.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Yüksek Lisans Tezi, Van, 2010. Çalışmada bölgemizde şüpheli bruselloz hastalarının kan örneklerinde brusella varlığı araştırılarak, brusella hastalığının tanısında kullanılan standart tüp aglütinasyon, Coombs anti brusella, Immuncapture aglutinasyon (BrucellaCAPT), ELISA, Kan kültürü ve Realtime PCR testlerinin tanı değerlerini ayrı ayrı ve bir arada değerlendirmek amaçlanmıştır. Bu amaçla Ocak 2009-Aralık 2009 tarihleri arasında Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Araştırma Hastanesi Enfeksiyon hastalıkları ve klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalına başvuran 44 hasta incelemeye alınmıştır. Çalışmaya dahil edilen hastalardan toplanan kan örnekleri iki ayrı tüpe alınmış, kan kültürü için toplanan kanlar direkt olarak cihaza aktarılmış, diğer örnek santrifüj edilerek elde edilen serumlar serolojik ve Moleküler PCR testlerin çalışılmasında kullanılmıştır.Yapılan çalışmalar sonucunda standart tüp aglutinasyon testinde 13 (% 29,5), Coombs anti brusella da 15 (% 34,0), Immunocapture aglutinasyon (BrucellaCAPT) testinde 21 (% 47,7), Brucella IgG ELISA’da 20 (% 45,4), kan kültüründe üç (% 6,8) ve Realtime PCR testinde üç (% 6,8) pozitiflik saptandı. Enfeksiyon hastalıkları kliniğinde brusella tanısı konmuş ve tadaviye alınmış olan hastalar esas alındığında, Standart Tüp Aglütinasyon testinin duyarlılığı % 72.2, özgüllüğü % 100, Coombs antibrusella testinin duyarlılığı % 77.7, özgüllüğü % 96.1, Immunocapture aglutinasyon (BrucellaCAPT) testinin duyarlılığı % 94.4, özgüllüğü % 84.6, ELISA testinin duyarlılığı % 77.7, özgüllüğü % 80.7, Kan kültürünün duyarlılığı %16.6, özgüllüğü %100, PCR testinin duyarlılığı % 16.6, ve özgüllüğü ise % 100 olarak elde edilmiştir. Bu altı yöntem içinden duyarlılığı en yüksek olan yöntem Immunocapture (BrucellaCAPT) aglütinasyondur. Bu test tüp aglütinasyonu ve coombs anti-brusella testini bir arada yapmakta ve brusellaya karşı oluşan IgG’nin yanında IgM ve IgA antikorlarını da tespit etmektedir. Immunocapture aglütinasyon (Brucellacapt) yönteminin blokan antikorları da yakalayarak yüksek titrede antikor tespit etmesi brusellozun tanı ve takibinde tedavinin izlenmesi açısından güvenle kullanılabileceğini düşündürmektedir. Anahtar Sözcükler: Bruselloz, teşhis yöntemleri