YRD. DOÇ. DR. ANDREW JOHN HARVEY

Barley xyloglucan endotransglycosylase (XTH) expression patterns Arpada xyloglucan endotransglycosylase (XTH) anlatım şekilleri

Bitki hücre duvarı çimlenme, vejetatif büyüme, çoğalma ve hücre yaşlanması gibi hücre siklusu aşamaları üzerinde etkisi vardır ve çevreden etkilenir. Ksiloglukan monokotillerde ve dikotillerde bulunan, selülozik olmayan ana polisakkarittir. Bitki hücre duvarının yapısında ve kuvvetinde rol oynar. Ksiloglukan zincirleri selüloz ile hidrojen bağı kurabilirler, böylece hücre duvarı yapısındaki bitişik mikrofibrilleri bağlayabilir ve hücre büyümesini kontrol edebilirler. Bitki ksiloglukan endo-transglikosilaz (XET) genleri CAZy sınıflandırmasında glikosid hidrolaz (GH) 16 ailesinin altailesi olarak yer alırlar. XET’lerin biyolojik görevleri net olarak gösterilememiş olsa bile hücre uzaması sırasında ksiloglukan polisakkaritlerini modifiye ederek hücre duvarı gevşemesinde önemli bir görevleri olduğu düşünülmektedir. Monokotillerde ve dikotillerde çok sayıda XET geni bulunmaktadır ancak bu genlerce şifrelenen enzimlerin hücre duvarı üzerindeki fonksiyonu tam olarak bilinmemektedir. Bu çalışmada tüm bu cevabı bilinmeyen sorulara cevap aramayı hedefledik. Hücre duvarı yapısı açısından önemlerini değerlendirebilmek için farklı günlerdeki arpa koleoptillerindeki ve çimlenme sırasındaki farklı arpa dokularındaki anlatım seviyelerini ölçtük. Arpayı model sistem olarak seçmemizin sebebi çimlenme sürecinin kolay bir şekilde çalışılabiliyor olması ve arpa XET genleri ve bunların anlatım düzeyleri hakkında bilgi bulunmasıdır. Bu çalışmada var olan bilgiler genişletilmiştir. Elde ettiğimiz datalar XTH1, XTH2, XTH3,. XTH4, XTH7, XTH8, XTH11, XTH12 genleri için yapılmış mikroarrey çalışmaları ile karşılaştırılmıştır. Bu çalışmadaki sonuçlar XTH2, XTH3,. XTH4, XTH7, XTH8, XTH11 için mikroarrey sonuçları ile örtüştüğünü göstermektedir.