PROF. MAHİNUR S. AKKAYA

Functional analysis of a mirna putatively involved in powdery mildew disease susceptibility in barley Arpada külleme hastalığı oluşumunda görev aldığı varsayılan bir mirna?nın fonksiyonel analizi

Arpa Turkiye’deki en önemli tahıllardan biridir ve arpa verimini düşüren külleme etkeni en yaygın patojendir. Bu problem karşısında ziraat mühendisleri çözüm olarak ıslah teknolojilerine başvurarak dirençli arpa türlerini seçer ve çoğaltırlar. Fakat bu kalıcı bir çözüm sunmaz çünkü patojen bitki direçliliğini yenmek için hızla evrilimektedirler. Moleküler bitki patalogları, ürün kaybına yönelik uzun vadeli çözümler üretmek için moleküler yöntemler kullanarak bitki-patojen ilişkisinin altındaki temel mekanizmaları anlamak için çalışırlar. Bu çalışmada, miR159 aracılığıyla arpa GAMyb transkripsiyon faktör regulasyonu sunulmuştur. Külleme patojeni inokulasyonundan değişik zamanlarda alınan örneklerle yapılan mikrodizin sonuçlarına göre, miR159’un expresyon seviyesi önemli bir farklılık göstermiştir. Biyoinformatik analizler sayesinde miRNA159’un arpada GAMyb genini hedeflediği ortaya çıkmıştır. Bu ilişkiyi araştırmak için hem hedef hem de miRNA Gateway klonlama yöntemi ile GFP içeren expresyon vektörlerine klonlanıp, Agrobakteriyum aracılıgıyla Nicotiana benthamiana’ya (tütün bitkisi) transfer edilmişlerdir. GFP ile yapılan gözlemlere göre miRNA159’un in vivo olarak GAMyb’yi hedefleyerek bu genin anlatımını düşürdüğü saptanmıştır. Bu çalışma iki yönden önemli bir çalışma olarak değerlendirilebilinir; (i) bu, varsayılan bir arpa miRNAsının fonksiyonunu biyolojik yönden öne koyan ve (ii) aynı zamanda oldukça pratik ve kullanışlı moleküler tekniklerin uygulandığı bir çalışmadır.