DOÇ. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL BAL

Çoklu dirençli Escherıchıa colı izolatlarında CTX-M, SHV ve TEM tiplerindeki beta-laktamaz direnç genlerinin moleküler yöntemlerle saptanması Molecular detection of CTX-M, SHV and TEM types of betalactamase resistance genes in multiple resistant Escherichia coli isolates

Antibiyotiklerin yoğun ve kontrolsüz kullanımları, bakterilerde antibiyotiklere karşı dirençten sorumlu genlerin yayılma özellikleri ile bir araya geldiğinde bakterilerde antibiyotiklere direnç gibi önemli bir problemin yaygın hale gelmesini sağlamaktadır. Günümüzde çok farklı tipteki ß-laktamazlara direnç gelişiminden sorumlu Geniş Spektrumlu ß-laktamazlar (GSBL)-Extended-Spectrum ß-lactamases, ESBL) özellikle Enterobacteriaceae üyeleri arasında hızla artmaktadır. Önemli bir hastane enfeksiyon etkeni olan E. coli Enterobacteriaceae üyesidir. Bu türde çok sayıda GSBL üreten suş saptanmıştır. Çalışmamızda çeşitli klinik örneklerden izole edilen 109 adet E. coli suşu kullanılmıştır. Çift disk sinerji ve kombine disk testleriyle fenotipik olarak GSBL pozitif olduğu belirlenen bu suşlardaki, üç önemli grubu oluşturan CTX-M, TEM ve SHV tiplerindeki ß-laktamazlara özgü genlerin varlığı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile incelenmiştir. PCR analizleri sonuçları, CTX-M tipindeki ß- laktamaz geninin 101 izolatta (%93), SHV tipindeki genin 79 izolatta (%73) ve TEM tipindeki genin ise 55 izolatta (%50) bulunduğunu göstermiştir. Ayrıca izolatların genetik ilişkisini ortaya koyabilmek amacıyla, 42 izolata Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC) bölgeleri kullanılarak ERIC-PCR uygulanmıştır. ERIC-PCR iki farklı primer ile gerçekleştirilmiştir. İzolatlara ait ERIC-PCR profillerinden elde edilen Dice benzerlik katsayısı değerlerinden Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) dendogramları elde edilmiştir. Çalışma sonuçları izolatların çeşitli klonal gruplara sahip olduğunu göstermiştir. Çalışma sonucunda, iki farklı primer ile elde edilen ana grup sayısının benzer olduğu saptanmıştır. Her iki dendogramda birbirine uygun şekilde yerleşim gösteren izolatlar ile birlikte farklı yerleşimlere sahip izolatlar da tespit edilmiştir. GSBL üreten mikroorganizmalar, aminoglikozidler ve florokinolonlar gibi diğer antibiyotiklere dirençlidirler. Bu nedenle, GSBL üreten mikroorganizmaların doğru tespiti, bu tip organizmalardan kaynaklanan enfeksiyonların tedavisinde ve kontrolünde büyük önem taşımaktadır

Phenotypic and molecular identification of escherichia coli isolates from various poultry with their antibiotic susceptibility patterns Çeşitli kümes hayvanlarından elde edilen escherichia coli izolatlarının fenotipik ve moleküler identikasyonu ile antibiyotik duyarlılık profilleri

İnsan klinik izolatlarında artan antibiyotik direnci global düzeydedir. Bu bağlamda, kümes hayvanlarında var olan antibiyotik dirençli bakterilerin besin zinciri yoluyla insanlara geçişi önemli olabilmektedir. Bu çalışmada, E. coli indikatör bir organizma olarak seçilerek, hayvanlardaki antibiyotik dirençli bakterilerin risk durumu incelenmiştir. Bu amaçla Kahramanmaraştaki bıldırcın ve tavuklara ait toplam 42 cloacae örneği E. coli izolasyonu için kullanılmıştır. Fenotipik identikasyon standart biyokimyasal testlere dayalı olarak yapılmıştır. Fenotipik identifikasyon E. coli spesifik Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) primerleri test edilmiştir. Son olarak, izolatların antibiyotik direnç profilleri çoğunluğu çeşitli β-lactam ve kinolonlardan oluşan (amoxicillin-clavulanic acid, piperacillin-tazobactam, ceftazidime, cefotaxime, ceftriaxone, cefpodoxime, aztreonam, ciprofloxacin, amikacin, ertapenem, imipenem, meropenem, trimethoprim-sulfamethoxazole) 13 adet antibiyotik için belirlenmiştir. Ayrıca, Genişlemiş Spekturumlu Beta-Lectomax (GSBL) üreten organizmalar double-disk synergy test (DDST) ile saptanmıştır. Sonuç olarak, 71 E. coli izolatı kümes hayvanlarına ait örneklerden fenotipik olarak identifiye edilmiştir. E. coli spesifik PCR primerleri ile iki kez yapılan PCR amplifikasyonları sonucunda 41 (58%) izolatın identikasyonu E. coli olarak doğrulanmıştır. Buna ilavaten, izolatların tümünün çalışılan antiyotiklerin çoğuna hassas olduğu bulunmuştur. Dirençli izolatlar sadece dört antibiyotik için tespit edilmiştir (ciprofloxacin, ertapenem, imipenem, meropenem). Bu antibiyotiklerden ciprofloxacin direnci en yüksek düzeyde (5.6%) iken, diğerleri için düşük düzeyde ve aynı oranda (1.1%) direnç saptanmıştır. DDST ile GSBL-üreten organizmanın hiç saptanmamış olması Kahramanmaraştaki kümes hayvanlarında GSBL-üreten organizmaların düşük prevalansa sahip olduğunu göstermektedir. Anahtar Kelimeler : Escherichia Coli , antibiyotik duyarlılık testi , kümes hayvanları , GSBL , Chromegar.